综合办公室

综合业务部门，处理中心日常行政和党务工作、文秘宣传、人事教育、档案管理、工资福利、精神文明建设、上传下达、协调监督、会务接待、对外联络等工作，同时为企业提供代管党组织关系及开展企业文化活动。

财务部

负责年度财务资金计划的编制、执行，财务收支核算与管理等中心日常财务工作，同时参与孵化资金贷款推荐和申请材料的审核、孵化资金贷款使用的跟踪和监理、企业有关费用结算以及为企业提供财税咨询服务。

物业保卫部

全面负责基地内房屋、设备的管理及提供后勤保障，确保各项物业服务到位。

企业发展部

企业服务部门，主要职责是为孵化企业入驻、项目申报、培训、融资、交流、咨询等一系列服务。

交流合作部

负责与中心外部（包括市内、国内、国外孵化器、众创空间同行及中小科技企业）交流与合作的日常业务接待与联络工作，与国家火炬中心、全国创业中心专委会、华东地区孵化器网络及长三角地区等的联络与沟通，做好国内外孵化器、众创空间同行及中小科技企业的技术合作与联络。

创新基金项目管理部

受市科委委托，组织实施开展创新创业大赛等活动，从事科技型中小企业技术创新基（资）金项目申报、受理、立项、实施跟踪、督查、协调、促进、组织验收等全过程辅助管理工作，负责项目年度统计与分析工作。

高新技术领域项目管理部

受市科委委托，负责市科委上海市科技小巨人工程项目项目的申请、审理及报批工作，实施跟踪、督查、协调、促进、组织验收等全过程辅助管理工作，并做好年度统计与分析工作。

项目认定部

负责高新技术成果转化项目认定申请的受理、组织、专家评审、评委会审定，将拟认定项目名单报送市科委审批，组织转化项目发证、动态跟踪及统计分析，转化项目“百佳十强”评议，管理成果转化工作联络站、转化项目代理申请中介机构和中介人员，转化认定项目数据库以及相关信息管理系统维护等工作。

政策服务部

负责科技创新政策的收集整理、分析、解读、培训、宣传、咨询与辅导、落实协调、统计分析、绩效评估和调查研究等，管理科技创新政策“一门式”窗口，联系市政府有关部门指定的联络员、培训师和咨询员，负责财税政策和人才政策的落政协调，协助《华东科技》杂志办好政策栏目。

科技金融部

负责科技创新金融政策的贯彻落实，利用科技创新金融政策开展上市融资、银企合作、创业投资等服务。

发展研究部

负责中心重大工作的调查研究，协助中心领导及有关部门进行管理体制和运行机制创新、重大工作方案等的研究，为中心领导决策提供咨询； 提出年度课题预算，归口管理中心研究类课题；承担重要文件和综合性、理论性文稿等起草工作；牵头组织编撰相关报告、简讯等工作。

技术转移部

承担市科委技术转移相关项目管理工作；对接本市及国内兄弟省市技术转移、成果转化服务工作，开展技术转移相关展览展示活动；负责对接科技部火炬中心组织在沪国家技术转移示范机构的相关统计、考核及管理服务等工作。

信息技术部

维护网络和软硬件环境，为单位信息化提供技术支撑，实施业务数据互通和集成。